Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cass4Q08EC4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cass4Q08EC4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms