Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp2Q08652 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp2Q08652 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms