Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pou6f1Q07916 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pou6f1Q07916 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms