Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cntn3Q07409 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cntn3Q07409 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms