Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah1bQ06985 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Siah1bQ06985 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms