Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox4Q06831 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox4Q06831 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox4Q06831 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms