Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrstQ06666 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrstQ06666 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms