Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprgQ05909 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprgQ05909 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprgQ05909 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms