Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox8Q04886 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox8Q04886 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms