Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelbQ04863 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelbQ04863 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelbQ04863 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms