Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nf1Q04690 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms