Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scg2Q03517 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scg2Q03517 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms