Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl7Q03366 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl7Q03366 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms