Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddr1Q03146 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddr1Q03146 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddr1Q03146 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms