Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mmp11Q02853 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp11Q02853 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp11Q02853 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms