Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Col6a2Q02788 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col6a2Q02788 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms