Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb4Q02738 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb4Q02738 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb4Q02738 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms