Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp39Q02525 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms