Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htr1fQ02284 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms