Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnb1Q02248 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnb1Q02248 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms