Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdcd1Q02242 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd1Q02242 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms