Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl1Q02067 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms