Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VcpQ01853 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VcpQ01853 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VcpQ01853 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VcpQ01853 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms