Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mc1rQ01727 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mc1rQ01727 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mc1rQ01727 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms