Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec23aQ01405 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23aQ01405 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms