Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmgcrQ01237 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms