Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2cQ01098 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms