Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pde1bQ01065 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde1bQ01065 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms