Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SeleQ00690 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms