Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itga4Q00651 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga4Q00651 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga4Q00651 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms