Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GabpaQ00422 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GabpaQ00422 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms