Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms