Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VldlrP98156 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms