Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama4P97927 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama4P97927 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama4P97927 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama4P97927 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama4P97927 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama4P97927 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lama4P97927 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama4P97927 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama4P97927 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms