Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Casp7P97864 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp7P97864 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms