Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr2cP97760 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr2cP97760 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms