Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms