Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smyd1P97443 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Smyd1P97443 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smyd1P97443 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms