Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc2P97363 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptlc2P97363 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptlc2P97363 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms