Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrp1P97333 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nrp1P97333 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nrp1P97333 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms