Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otx1P80205 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otx1P80205 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms