Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf3P70671 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms