Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sparcl1P70663 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sparcl1P70663 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sparcl1P70663 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms