Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp9xP70398 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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