Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ufd1P70362 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms