Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msx3P70354 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msx3P70354 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msx3P70354 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msx3P70354 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms