Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp4P70343 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp4P70343 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms