Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vamp7P70280 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms