Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkn1P70268 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pkn1P70268 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pkn1P70268 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkn1P70268 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkn1P70268 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkn1P70268 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkn1P70268 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkn1P70268 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkn1P70268 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkn1P70268 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkn1P70268 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkn1P70268 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkn1P70268 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkn1P70268 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkn1P70268 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkn1P70268 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pkn1P70268 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkn1P70268 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkn1P70268 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkn1P70268 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkn1P70268 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkn1P70268 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms