Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plxna3P70208 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plxna3P70208 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plxna3P70208 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms