Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Traf5P70191 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf5P70191 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf5P70191 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf5P70191 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf5P70191 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf5P70191 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf5P70191 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf5P70191 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms